目前，惠州机场共开通了36条航线，通航30个城市，包括北京、上海、成都、昆明、西安、重庆、杭州、南京、郑州、长沙、青岛、武汉、天津、哈尔滨、贵阳、三亚、沈阳、南昌、宁波、温州、合肥、无锡、丽江、湛江、运城、襄阳、南充、上饶、河池、大连。
惠州～北京(首都/南苑)、惠州～上海(浦东)、惠州～南京、惠州～杭州、惠州～西安、惠州～成都、惠州～昆明、惠州～重庆、惠州～海口、惠州～天津、惠州～兰州、惠州～郑州、惠州～武汉、惠州～哈尔滨、惠州～贵阳、惠州～无锡、惠州～温州、惠州～南昌、惠州～南充、惠州～衡阳、惠州～上饶、惠州～湛江。
另外，今年春秋季节，惠州还将增加8条航线。