对方撤诉后公司会有记录。
法院必须保留存档。凡是到法院起诉，被立案受理的，都有一个案件编号。
无论案件是判决、调解，还是撤诉，都必须形成卷宗存档。
法律依据：
宣判前，原告申请撤诉的，是否准许，由人民法院裁定。
人民法院裁定不准许撤诉的，原告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，可以缺席判决。
第一百四十六条
原告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以按撤诉处理；被告反诉的，可以缺席判决。
撤诉意味着原告放弃了对被告的追究，如果再次起诉，需要重新进行诉讼程序，包括再次提交证据、重新进行庭审等，增加了诉讼成本和时间成本。
此外，重新起诉也可能面临证据收集、证明责任等方面的困难，从而对案件的胜诉率产生影响。
因此，在决定撤诉后是否再次起诉时，要对案件进行全面分析和权衡，确保再次起诉可行且有充分的准备。